Over kirkens vestindgang finder vi kirkens hovedorgel, et pragtstykke fra Markussen og Søn, som blev installeret i kirken i forbindelse med hovedrenovering i 1962 og intoneret efter daværende organist, Elmers foretrukne lidt skarpe klangfarve. Orgelets 39 stemmer er inddelt i fire grupper, oppefra Brystværket, Hovedværket, Rygpositivet og Pedalværket. Som typisk for Markussen og Søn er Brystværket udstyret med foldelåger, hvorved gives effekten af et svelleværk og en des større dynamik i hele orgelet. 

Hør kirkens tidligere organist på orgelet her

Luften til de mange piber leveres af en blæser i skabet modsat trappeopgangen gennem en overvejende mekanisk sløjfevindlade, dvs. mekanisk traktur og registratur på de fleste stemmer.

For at udnytte orgelets mange muligheder bedre og lette spillet væsentligt, blev der i 1998 installeret setzersystem med 4 * 100 programmérbare kombinationer. Som et kuriosum kan nævnes, at et orgel med 39 stemmer har i alt 549 755 813 887 kombinationsmuligheder, hvilket kun betyder, at uanset hvor meget organisten øver, vil der altid være flere muligheder.

Stemmerne fordeler sig, som nedenstående:

III Brystværk II Hovedværk I Rygpositiv Pedal
Gedakt 8' Gedaktpommer 16' Kobbelfløjte 8' Principal 16'
Blokfløjte 4' Principal 8' Principal 4' Subbas 16'
Quintatøn 4' Rørfløjte 8' Rørfløjte 4' Oktav 8'
Principal 2' Oktav 4' Oktav 2' Gedakt 8'
Gedaktfløjte 2' Spidsfløjte 4' Waldfløjte 2' Oktav 4'
Sivfløjte 1' Spidsquint 22/3' Nasat 11/3' Nathorn 2'
Cymbel II Oktav 2' Scharf IV Mixtur V
Regal 16' Mixtur IV-V Sesquialtera II Fagot 16'
Skalmeje 8' Cymbel II Dulcian 8' Trompet 8'
Tremulant Trompet 8' Tremulant Zink 4'
      Kornet 2'

Af kobler findes: H+B, H+R, P+R, P+H, P+B

Det nuværende orgel er det fjerde i rækken. Da kirken blev indviet i 1600 havde man taget orgelet fra den gamle kirke med, men allerede 1606 byggede Joachim Willers i Salzwedel et nyt orgel for 75 daler, som i 1642 blev forbedret. Dette orgel udtjente sin værnepligt i godt 200 år inden det blev udskiftet i 1854 af et nyt orgel leveret fra Demant og Søn, som forøvrigt blev udvidet og restaureret i 1923. Rygpositivet af dette orgel er nu installeret i Menighedshuset.